Балис Сруога родился в дер. Байбокай Паневежского уезда Ковенской губернии (ныне Биржайский район, Литва). Учился в гимназии в Поневеже (Литва), затем поступил в Лесной институт в Петрограде (1914), позднее изучал литературу на историко-филологическом факультете Петроградского и Московского университета(1916—1918).

В 1918 году вернулся в Литву. Один из инициаторов создания сатирического театра «Вилколакис» (в пер. «Волкодав») (1919—1925).

В 1921—1924 учился в Мюнхенском университете. С 1924 преподавал в Литовском университете в Каунасе(с 1930 носившего название Университета Витаутаса Великого), русский фольклор и литературу, курс истории театра, вёл семинар по театроведению. Профессор Университета Витаутаса Великого (с 1932). В1940—1943 и после войны (1945—1947) преподавал в Вильнюсском университете.

В 1943—1945 узник гитлеровского концлагеря «Штутгоф». Жена писателя историк Ванда Даугирдайте-Сруогене (1899—1997) в 1944 году, с приближением советских войск к Литве, выехала на Запад; умерла в Соединённых Штатах.

Умер Б. Сруога вскоре после войны, в 1947 году, в Вильнюсе. Похоронен на вильнюсском кладбище Расу.