Родилась в еврейской семье. Родители: фармацевт Соломон Нотович (Натанович) Гинзбург (1876—1938, уроженец Гродно), владелец аптекарского магазина в доме Пузенковых, и Ревекка Марковна Гинзбург (1881—1949, уроженка Вильно).

В 1905 году семья переехала в Казань, где Евгения училась сначала в женской гимназии, а затем в обычной школе.

С 1920 по 1922 год Евгения Гинзбург училась на факультете общественных наук в Казанском университете, после чего перевелась на 3-й курс общественного отделения Казанского Восточного педагогического института, который окончила в июне 1924 года (специальность «история», в дальнейшем защитилась как кандидат исторических наук). Член ВКП(б) с 1932 года, работник образования в Казани (работала в пединституте), сотрудник областной газеты «Красная Татария» (зав. отделом культуры), корреспондент «Литературной газеты». Вспоминала: «1935 год был для меня ужасен. Нервы готовы были сдать. Преследовала настойчивая мысль о самоубийстве». В августе того же года как «отец и мать врага народа» были арестованы её родители. Провела 10 лет в тюрьмах (в том числе в Бутырках и Ярославском политизоляторе) и колымских лагерях (Эльген, Таскан), 8 лет в «бессрочной» ссылке.

15 февраля 1947 года Евгения Гинзбург была освобождена из заключения с поражением в гражданских правах на 5 лет. Первое время работала в детском саду посёлка Таскан, через полгода она переехала в Магадан, где продолжила работать в детском саду воспитательницей и музработником.

В ссылке в Магадане Евгения Гинзбург вышла замуж за заключённого доктора Антона Яковлевича Вальтера. В 1949 году пара удочерила девочку, полную сироту Антонину Хинчинскую.

В 1959 году скончался А. Я. Вальтер.

В 1966 году Евгения Соломоновна переехала в Москву и поселилась в писательском кооперативном доме на 1-й Аэропортовской улице, работала в журналистике.

Похоронена в Москве на Кузьминском кладбище (участок № 61).